Email: malgorzata.kotulska@pwr.edu.pl

Jednostka: Wydział Podstawowych Problemów Techniki » Katedra Inżynierii Biomedycznej

pl. Grunwaldzki 13, Wrocław
bud. D-1, pok. 219.3
tel. 71 320 3974

Konsultacje

• piątek 11.15-13.00, zoom po wcześniejszym umówieniu emailowym

---

Zainteresowania naukowe

• Bioinformatyka białek; biofizyka; elektroporacja; elektrochemioterapia.

---

Najważniejsze publikacje z ostatnich lat

2017

• Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Duda-Madej A., Mackiewicz P., Kotulska M., Amyloidogenic motifs revealed by n-gram analysis. Scientific Reports 2017;7(1):12961. https://www.nature.com/articles/s41598-017-13210-9, MNiSW: 40; 5-IF: 4,847
• Wozniak P.P., Konopka B.M., Xu J, Vriend G., Kotulska M., Forecasting residue-residue contact prediction accuracy, Bioinformatics 2017, 1;33(21):3405-3414. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx416, MNiSW: 45; 5-IF: 8,044
• Wozniak P.P., Vriend G., Kotulska M., Correlated mutations select misfolded from properly folded proteins. Bioinformatics 2017;33(10):1497-1504. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx013, MNiSW: 45; 5-IF: 8,044

2016

• Kulbacka J., Pucek A., Kotulska M., Dubinska-Magiera M., Rossowska J., Rols M.P., Wilk K., Electroporation and lipid nanoparticles with cyanine IR-780 and flavonoids as efficient vectors to enhanced drug delivery in colon cancer. Bioelectrochemistry 2016, 110:19-31. https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00232-016-9906-1, MNiSW: 35; 5-IF: 3,556

2015

• Woźniak P.P., Kotulska M., AmyLoad: website dedicated to amyloidogenic protein fragments. Bioinformatics 2015, 31(20):3395-3397. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv375, MNiSW: 45; 5-IF: 8,044
  

Publikacje w bazie DONA

---

Wybrane publikacje
1	Artykuł 2025 Aleksandra Kalitnik, Anna Lassota, Oliwia Polańska, Marlena E Gąsior-Głogowska, Monika E Szefczyk, Agnieszka Barbach, Jarosław Chilimoniuk, Izabela Jęśkowiak-Kossakowska, Alicja W Wojciechowska, Jakub Wojciechowski, Natalia Szulc, Małgorzata Kotulska, Michał Burdukiewicz, Experimental methods for studying amyloid cross-interactions. Protein Science. 2025, vol. 34, nr 6, art. e70151, s. 1-18. ISSN: 0961-8368; 1469-896X Zasoby:DOISFX
2	Artykuł 2025 Oliwia Polańska, Natalia Szulc, Witold W Dyrka, Alicja W Wojciechowska, Małgorzata Kotulska, Andrzej M Żak, Marlena E Gąsior-Głogowska, Monika E Szefczyk, Environmental sensitivity of amyloidogenic motifs in fungal NOD-like receptor-mediated immunity: molecular and structural insights into amyloid assembly. International Journal of Biological Macromolecules. 2025, vol. 304, Pt. 1, art. 140773, s. 1-13. ISSN: 0141-8130; 1879-0003 Zasoby:DOIURLSFX
3	Artykuł 2025 Aleksandra Kalitnik, Alicja W Wojciechowska, Jakub Wojciechowski, Oliwia Polańska, Przemysław S Sareło, Monika E Szefczyk, Małgorzata Kotulska, Synthetic deformylated α-helical PSMα3 as a selective inhibitor of human amyloid aggregation. Scientific Reports. 2025, vol. 15, art. 43071, s. 1-15. ISSN: 2045-2322; 2045-2322 Zasoby:DOIURLSFX
4	Artykuł 2024 Aleksandra Kalitnik, Monika E Szefczyk, Alicja W Wojciechowska, Jakub Wojciechowski, Marlena E Gąsior-Głogowska, Joanna Olesiak-Bańska, Małgorzata Kotulska, Cytotoxic Staphylococcus aureus PSMα3 inhibits the aggregation of human insulin in vitro. Physical Chemistry Chemical Physics. 2024, vol. 26, nr 21, s. 15587-15599. ISSN: 1463-9076; 1463-9084 Zasoby:DOIURLSFX
5	Artykuł 2024 Natalia Szulc, Marlena E Gąsior-Głogowska, Paweł Żyłka, Monika E Szefczyk, Jakub Wojciechowski, Andrzej M Żak, Witold W Dyrka, Aleksandra M Kaczorowska, Michał Burdukiewicz, Mounir Tarek, Małgorzata Kotulska, Structural effects of charge destabilization and amino acid substitutions in amyloid fragments of CsgA. Spectrochimica Acta. Part A, Molecular and Biomolecular Spectroscopy. 2024, vol. 313, art. 124094, s. 1-12. ISSN: 1386-1425; 1873-3557 Zasoby:DOIURLSFX
6	Artykuł 2023 Alicja W Wojciechowska, Jakub Wojciechowski, Natalia Szulc, Małgorzata Kotulska, The role of tandem repeats in bacterial functional amyloids. Journal of Structural Biology. 2023, vol. 215, nr 3, art. 108002, s. 1-12. ISSN: 1095-8657; 1047-8477 Zasoby:DOIURLSFX
7	Artykuł 2023 Michał Burdukiewicz, Dominik Rafacz, Agnieszka Barbach, Katarzyna Hubicka, Laura Bąkała, Anna Lassota, Jakub Stecko, Natalia Szymańska, Jakub Wojciechowski, Dominika Kozakiewicz, Natalia Szulc, Jarosław Chilimoniuk, Izabela Jęśkowiak-Kosakowska, Marlena E Gąsior-Głogowska, Małgorzata Kotulska, AmyloGraph: a comprehensive database of amyloid–amyloid interactions. Nucleic Acids Research. 2023, vol. 51, nr D1, s. D352-D357. ISSN: 0305-1048; 1362-4962 Zasoby:DOIURLSFX
8	Artykuł 2023 Jakub Wojciechowski, Witold Szczurek, Natalia Szulc, Monika E Szefczyk, Małgorzata Kotulska, PACT - Prediction of amyloid cross-interaction by threading. Scientific Reports. 2023, vol. 13, art. 22268, s. 1-10. ISSN: 2045-2322 Zasoby:DOIURLSFX
9	Artykuł 2022 Muntasir Kamal, Levon Tokmakjian, Jessica Knox, Peter Mastrangelo, Jingxiu Ji, Hao Cai, Jakub Wojciechowski, Michael P Hughes, Kristóf Takács, Xiaoquan Chu, Jianfeng Pei, Vince Grolmusz, Małgorzata Kotulska, Julie Deborah Forman-Kay, Peter J Roy, A spatiotemporal reconstruction of the C. elegans pharyngeal cuticle reveals a structure rich in phase-separating proteins. eLife. 2022, vol. 11, art. e79396, s. 1-34. ISSN: 2050-084X Zasoby:DOIURLSFX
10	Artykuł 2022 Alicja W Wojciechowska, Małgorzata Kotulska, Topological analysis as a tool for detection of abnormalities in protein-protein interaction data. Bioinformatics. 2022, vol. 38, nr 16, s. 3968-3975. ISSN: 1460-2059; 1367-4803 Zasoby:DOIURLSFX
11	Rozdział w monografii 2022 Małgorzata Kotulska, Jakub Wojciechowski, Bioinformatics methods in predicting amyloid propensity of peptides and proteins. W: Computer simulations of aggregation of proteins and peptides / eds. Mai Suan Li [i in.]. New York : Humana Press, 2022. s. 1-15. ISBN: 978-1-0716-1545-4; 978-1-0716-1546-1 Zasoby:DOIURLSFX

Wszystkie publikacje pracownika