prof. dr hab. inż. Małgorzata Kotulska

Email: malgorzata.kotulska@pwr.edu.pl

---

Jednostka: Wydział Podstawowych Problemów Techniki » Katedra Inżynierii Biomedycznej

---

pl. Grunwaldzki 13, Wrocław
bud. D-1, pok. 219.3
tel. 71 320 3974

Konsultacje

• piątek 11.15-13.00, zoom po wcześniejszym umówieniu emailowym

Zainteresowania naukowe

• Bioinformatyka białek; biofizyka; elektroporacja; elektrochemioterapia.

Najważniejsze publikacje z ostatnich lat

2017

• Burdukiewicz M., Sobczyk P., Rödiger S., Duda-Madej A., Mackiewicz P., Kotulska M., Amyloidogenic motifs revealed by n-gram analysis. Scientific Reports 2017;7(1):12961. https://www.nature.com/articles/s41598-017-13210-9, MNiSW: 40; 5-IF: 4,847
• Wozniak P.P., Konopka B.M., Xu J, Vriend G., Kotulska M., Forecasting residue-residue contact prediction accuracy, Bioinformatics 2017, 1;33(21):3405-3414. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx416, MNiSW: 45; 5-IF: 8,044
• Wozniak P.P., Vriend G., Kotulska M., Correlated mutations select misfolded from properly folded proteins. Bioinformatics 2017;33(10):1497-1504. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx013, MNiSW: 45; 5-IF: 8,044

2016

• Kulbacka J., Pucek A., Kotulska M., Dubinska-Magiera M., Rossowska J., Rols M.P., Wilk K., Electroporation and lipid nanoparticles with cyanine IR-780 and flavonoids as efficient vectors to enhanced drug delivery in colon cancer. Bioelectrochemistry 2016, 110:19-31. https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00232-016-9906-1, MNiSW: 35; 5-IF: 3,556

2015

• Woźniak P.P., Kotulska M., AmyLoad: website dedicated to amyloidogenic protein fragments. Bioinformatics 2015, 31(20):3395-3397. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv375, MNiSW: 45; 5-IF: 8,044
  

Publikacje w bazie DONA

Wybrane publikacje
1	Artykuł 2026 Alicja W Wojciechowska Jakub Wojciechowski Kinga Zielińska, Johannes Soeding, Tomasz Kościołek, Małgorzata Kotulska Aggregation in gut: on the link between neurodegeneration and bacterial functional amyloids. npj Biofilms and Microbiomes. 2026, vol. 12, art. 127, s. [1-27]. ISSN: 2055-5008 Zasoby:DOIURLSFX
2	Artykuł 2025 Aleksandra Kalitnik Alicja W Wojciechowska Jakub Wojciechowski Oliwia Polańska Przemysław S Sareło Monika E Szefczyk Małgorzata Kotulska Synthetic deformylated α-helical PSMα3 as a selective inhibitor of human amyloid aggregation. Scientific Reports. 2025, vol. 15, art. 43071, s. 1-15. ISSN: 2045-2322; 2045-2322 Zasoby:DOIURLSFX
3	Artykuł 2025 Aleksandra Kalitnik Anna Lassota, Oliwia Polańska Marlena E Gąsior-Głogowska Monika E Szefczyk Agnieszka Barbach, Jarosław Chilimoniuk, Izabela Jęśkowiak-Kossakowska, Alicja W Wojciechowska Jakub Wojciechowski Natalia Szulc, Małgorzata Kotulska Michał Burdukiewicz, Experimental methods for studying amyloid cross-interactions. Protein Science. 2025, vol. 34, nr 6, art. e70151, s. 1-18. ISSN: 0961-8368; 1469-896X Zasoby:DOISFX
4	Artykuł 2025 Oliwia Polańska Natalia Szulc, Witold W Dyrka Alicja W Wojciechowska Małgorzata Kotulska Andrzej M Żak Marlena E Gąsior-Głogowska Monika E Szefczyk Environmental sensitivity of amyloidogenic motifs in fungal NOD-like receptor-mediated immunity: molecular and structural insights into amyloid assembly. International Journal of Biological Macromolecules. 2025, vol. 304, Pt. 1, art. 140773, s. 1-13. ISSN: 0141-8130; 1879-0003 Zasoby:DOIURLSFX
5	Artykuł 2024 Aleksandra Kalitnik Monika E Szefczyk Alicja W Wojciechowska Jakub Wojciechowski Marlena E Gąsior-Głogowska Joanna Olesiak-Bańska Małgorzata Kotulska Cytotoxic Staphylococcus aureus PSMα3 inhibits the aggregation of human insulin in vitro. Physical Chemistry Chemical Physics. 2024, vol. 26, nr 21, s. 15587-15599. ISSN: 1463-9076; 1463-9084 Zasoby:DOIURLSFX
6	Artykuł 2024 Natalia Szulc, Marlena E Gąsior-Głogowska Paweł Żyłka Monika E Szefczyk Jakub Wojciechowski Andrzej M Żak Witold W Dyrka Aleksandra M Kaczorowska Michał Burdukiewicz, Mounir Tarek, Małgorzata Kotulska Structural effects of charge destabilization and amino acid substitutions in amyloid fragments of CsgA. Spectrochimica Acta. Part A, Molecular and Biomolecular Spectroscopy. 2024, vol. 313, art. 124094, s. 1-12. ISSN: 1386-1425; 1873-3557 Zasoby:DOIURLSFX
7	Artykuł 2023 Jakub Wojciechowski Witold Szczurek Natalia Szulc, Monika E Szefczyk Małgorzata Kotulska PACT - Prediction of amyloid cross-interaction by threading. Scientific Reports. 2023, vol. 13, art. 22268, s. 1-10. ISSN: 2045-2322 Zasoby:DOIURLSFX
8	Artykuł 2023 Alicja W Wojciechowska Jakub Wojciechowski Natalia Szulc, Małgorzata Kotulska The role of tandem repeats in bacterial functional amyloids. Journal of Structural Biology. 2023, vol. 215, nr 3, art. 108002, s. 1-12. ISSN: 1095-8657; 1047-8477 Zasoby:DOIURLSFX
9	Artykuł 2023 Michał Burdukiewicz, Dominik Rafacz, Agnieszka Barbach, Katarzyna Hubicka Laura Bąkała, Anna Lassota, Jakub Stecko, Natalia Szymańska, Jakub Wojciechowski Dominika Kozakiewicz, Natalia Szulc, Jarosław Chilimoniuk, Izabela Jęśkowiak-Kosakowska, Marlena E Gąsior-Głogowska Małgorzata Kotulska AmyloGraph: a comprehensive database of amyloid–amyloid interactions. Nucleic Acids Research. 2023, vol. 51, nr D1, s. D352-D357. ISSN: 0305-1048; 1362-4962 Zasoby:DOIURLSFX
10	Artykuł 2022 Muntasir Kamal, Levon Tokmakjian, Jessica Knox, Peter Mastrangelo, Jingxiu Ji, Hao Cai, Jakub Wojciechowski Michael P Hughes, Kristóf Takács, Xiaoquan Chu, Jianfeng Pei, Vince Grolmusz, Małgorzata Kotulska Julie Deborah Forman-Kay, Peter J Roy, A spatiotemporal reconstruction of the C. elegans pharyngeal cuticle reveals a structure rich in phase-separating proteins. eLife. 2022, vol. 11, art. e79396, s. 1-34. ISSN: 2050-084X Zasoby:DOIURLSFX
11	Artykuł 2022 Alicja W Wojciechowska Małgorzata Kotulska Topological analysis as a tool for detection of abnormalities in protein-protein interaction data. Bioinformatics. 2022, vol. 38, nr 16, s. 3968-3975. ISSN: 1460-2059; 1367-4803 Zasoby:DOIURLSFX

Wszystkie publikacje pracownika