A A+ A++
A A A A

Wydział Podstawowych Problemów Techniki

Wydział Podstawowych Problemów Techniki

Wydział Podstawowych Problemów Techniki
Wyb. Wyspiańskiego 27
50-370 Wrocław
NIP 896-000-58-51
budynek A-1, pok. 234
tel. 71 320 45 53 (sekretariat)

wppt.sekretariat@pwr.edu.pl

dr hab. inż. Witold Dyrka

Email: witold.dyrka@pwr.edu.pl
Jednostka: Wydział Podstawowych Problemów Techniki » Katedra Inżynierii Biomedycznej

pl. Grunwaldzki 13, Wrocław
bud. D-1, pok. 118
tel. 71 320 4461

Zainteresowania naukowe

  • amyloidy sygnałowe | analiza obrazów biomedycznych | białka odpornościowe grzybów | bioinformatyka | bioobliczenia | gramatyki formalne – zastosowania | patomorfologia cyfrowa | proteomika | uczenie maszynowe | sztuczna inteligencja

Wybrane publikacje
1
Artykuł
2025
Krzysztof G Pysz Jakub Gałązka, Witold W Dyrka
Harnessing deep learning for proteome-scale detection of amyloid signaling motifs. Bioinformatics. 2025, vol. 41, nr 1, suppl. 1, s. 420–428. ISSN: 1367-4803; 1367-4811
Zasoby:DOIURLSFXImpact FactorLista FiladelfijskaLista MNiSWOpen Access
2
Artykuł
2025
Oliwia Polańska Natalia Szulc, Witold W Dyrka Alicja W Wojciechowska Małgorzata Kotulska Andrzej M Żak Marlena E Gąsior-Głogowska Monika E Szefczyk
Environmental sensitivity of amyloidogenic motifs in fungal NOD-like receptor-mediated immunity: molecular and structural insights into amyloid assembly. International Journal of Biological Macromolecules. 2025, vol. 304, Pt. 1, art. 140773, s. 1-13. ISSN: 0141-8130; 1879-0003
Zasoby:DOIURLSFXImpact FactorLista FiladelfijskaLista MNiSW
3
Artykuł
2024
Natalia Szulc, Marlena E Gąsior-Głogowska Paweł Żyłka Monika E Szefczyk Jakub Wojciechowski Andrzej M Żak Witold W Dyrka Aleksandra M Kaczorowska Michał Burdukiewicz, Mounir Tarek, Małgorzata Kotulska
Structural effects of charge destabilization and amino acid substitutions in amyloid fragments of CsgA. Spectrochimica Acta. Part A, Molecular and Biomolecular Spectroscopy. 2024, vol. 313, art. 124094, s. 1-12. ISSN: 1386-1425; 1873-3557
Zasoby:DOIURLSFXImpact FactorLista FiladelfijskaLista MNiSW
4
Artykuł
2022
Jakub Wojciechowski Emirhan Tekoglu, Marlena E Gąsior-Głogowska Virginie Coustou, Natalia Szulc, Monika E Szefczyk Marta Kopaczyńska Sven J Saupe, Witold W Dyrka
Exploring a diverse world of effector domains and amyloid signaling motifs in fungal NLR proteins. PLoS Computational Biology. 2022, vol. 18, nr 12, art. e1010787, s. 1-36. ISSN: 1553-734X; 1553-7358
Zasoby:DOIURLSFXImpact FactorLista FiladelfijskaLista MNiSWOpen Access
5
Artykuł
2022
Corinne Clave, Witold W Dyrka Elizabeth A Turcotte, Alexandra Granger-Farbos, Lea Ibarlosa, Benoît Pinson, Russell E Vance, Sven J Saupe, Asen Daskalov,
Fungal gasdermin-like proteins are controlled by proteolytic cleavage. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2022, vol. 119, nr 7, art. e2109418119, s. 1-11. ISSN: 0027-8424; 1091-6490
Zasoby:DOISFXImpact FactorLista FiladelfijskaLista MNiSW
6
Artykuł
2021
Witold W Dyrka Marlena E Gąsior-Głogowska Monika E Szefczyk Natalia Szulc,
Searching for universal model of amyloid signaling motifs using probabilistic context-free grammars. BMC Bioinformatics. 2021, vol. 22 , art. 222, s. 1-28. ISSN: 1471-2105
Zasoby:DOIURLSFXImpact FactorLista FiladelfijskaLista MNiSWOpen Access
7
Rozdział w monografii
2020
Asen Daskalov, Witold W Dyrka Sven J Saupe,
NLR function in fungi as revealed by the study of self/non-self recognition systems. W: Genetics and biotechnology / eds. J. Philipp Benz and Kerstin Schipper. 3rd ed. Cham : Springer, cop. 2020. s. 123-141. ISBN: 978-3-030-49923-5; 978-3-030-49924-2
Zasoby:DOIURLSFX
8
Artykuł
2020
Witold W Dyrka Virginie Coustou, Asen Daskalov, Alons Lends, Thierry Bardin, Mélanie Berbon, Brice Kauffmann, Corinne Blancard, Bénédicte Salin, Antoine Loquet, Sven J Saupe,
Identification of NLR-associated amyloid signaling motifs in bacterial genomes. Journal of Molecular Biology. 2020, vol. 432, nr 23, s. 6005-6027. ISSN: 0022-2836; 1089-8638
Zasoby:DOIURLSFXImpact FactorLista FiladelfijskaLista MNiSW
9
Referat konferencyjny
2020
Olgierd Unold Witold W Dyrka Mateusz O Gabor
Unsupervised grammar induction for revealing the internal structure of protein sequence motifs. W: Artificial intelligence in medicine : 18th International Conference on Artificial Intelligence in Medicine, AIME 2020, Minneapolis, MN, USA, August 25–28, 2020 : proceedings / eds. Martin Michalowski, Robert Moskovitch. Cham : Springer, cop. 2020. s. 299-309. ISBN: 978-3-030-59136-6; 978-3-030-59137-3
Zasoby:DOIURLSFX
10
Komunikat konferencyjny
2019
Robert Kowalski, Mateusz Pyzik, Witold W Dyrka
Towards improved evolutionary learning of probabilistic context-free grammars for protein sequences. W: EVO* 2019 : The Leading European Event on Bio-Inspired Computation : Leipzig, Germany, 24-26 April 2019 : late breaking abstracts / eds. A. M. Mora, A. I. Esparcia-Alcázar. [B.m. : b.w., 2019]. s. 10-11.
Zasoby:URLOpen Access

Wszystkie publikacje pracownika

Politechnika Wrocławska ©